Comment les scientifiques essaient de détecter les nouveaux virus avant qu’ils ne provoquent des pandémies

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«Si nous l’avions mis en place en 2019, alors lorsque ce virus a frappé les États-Unis, nous aurions eu un accès immédiat aux données qui nous auraient permis de le voir circuler à New York, par exemple, sans rien faire de différent», a déclaré le Dr Dit Mina.

Bien que l’observatoire n’aurait pas été en mesure d’identifier le nouveau coronavirus, il aurait révélé un nombre inhabituellement élevé d’infections de la famille des coronavirus, qui comprend celles qui causent le rhume. Cela aurait également pu montrer que le nouveau coronavirus interagissait avec le système immunitaire des patients de manière inattendue, entraînant des marqueurs révélateurs dans le sang. Cela aurait été un signal pour commencer le séquençage génétique des échantillons de patients, pour identifier le coupable, et pourrait avoir fourni des raisons de fermer la ville plus tôt, a déclaré le Dr Mina. (De même, la sérologie ne serait pas en mesure de détecter l’urgence d’un nouveau variant de virus, comme les variants de coronavirus contagieux qui ont été découverts en Afrique du Sud et en Angleterre avant de se propager ailleurs. Pour cela, les chercheurs doivent s’appuyer sur le séquençage génomique standard des échantillons de test viral. )

L’observatoire nécessiterait des accords avec les hôpitaux, les banques de sang et d’autres sources de sang, ainsi qu’un système pour obtenir le consentement des patients et des donneurs. Elle est également confrontée au problème du financement, a noté Alex Greninger, virologue à l’Université de Washington. Les compagnies d’assurance maladie ne paieraient probablement pas la facture, car les tests sérologiques ne sont généralement pas utilisés par les médecins pour traiter les gens.

Le Dr Mina a estimé que l’observatoire coûterait environ 100 millions de dollars pour démarrer. Il a souligné que, selon ses calculs, le gouvernement fédéral a alloué plus du double de ce montant à la société de diagnostic Ellume pour produire suffisamment de tests Covid rapides pour couvrir la demande américaine pendant seulement quelques jours. Un observatoire des agents pathogènes, a-t-il dit, est comme un système de prévision météorologique qui s’appuie sur un grand nombre de bouées et de capteurs dans le monde entier, rapportant passivement les événements où et quand ils surviennent. Ces systèmes ont été financés par des subventions gouvernementales et sont largement appréciés.

Le pouvoir prédictif de la sérologie vaut l’investissement, a déclaré Jessica Metcalf, épidémiologiste à Princeton et l’un des membres de l’équipe de l’observatoire. Il y a quelques années, elle et ses collaborateurs ont découvert dans une petite enquête que l’immunité contre la rougeole était inquiétante à Madagascar. En effet, en 2018, une épidémie s’est installée, tuant plus de 10000 enfants.

Désormais, les demi-millions d’échantillons de plasma dans les congélateurs du Dr Mina, collectés par la société de don de plasma Octopharma sur des sites à travers le pays l’année dernière, commencent à subir des tests sérologiques axés sur le nouveau coronavirus, financés par une subvention de 2 millions de dollars d’Open Philanthropy. . Les tests ont dû attendre que les chercheurs mettent en place une nouvelle installation de test robotique et traitent les échantillons, mais ils travaillent maintenant sur leurs premiers lots.

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